L'école a été fondée en 1974 par M. Silvano Fasolis, sous le nom de l’Ecole de Musique de Saint-Imier. Elle est devenue après quelques années l’Ecole de Musique du Jura Bernois (EMJB), institution décentralisée de formation musicale au service de toute une région.
L'école est organisée notamment en Association et les organes qui la structurent sont:
- l'assemblée générale
- le comité la direction
- les vérificateurs de compte.
Les communes partenaires sont représentées à l'assemblée générale.
Le comité de l'EMJB est élu par l'assemblée générale. Son rôle consiste prioritairement à exercer une surveillance du fonctionnement de l'école et à définir, en dialogue avec la direction, les grands axes stratégiques du développement de l'institution. Il se compose des membres suivant-e-s:
- M. Mario Annoni, Président, La Neuveville
- M. Martin Rytz, Vice-président, Saint-Imier
- M. Pierre Amstutz, Député, Corgémont
- Mme Stéphanie Amstutz, représentante de la Municipalité de Tavannes
- M. Jean-Luc Berberat, représentant de la Municipalité de Saint-Imier
- Mme Carine Bassin, représentante de la Municipalité de Tramelan
- M. Jacques-Henri Jufer, représent de l'association Jura bernois.Bienne
- M. Philippe Châtelain, représentant Diapason SA, Villeret
- M. Blaise Brunner, représentant des professeurs, La Chaux-de-Fonds
- M. Philippe Krüttli, directeur, Saint-Imier
- Mme Sandra Oppliger, secrétaire, Saint-Imier
L'EMJB est membre de l'Association bernoise des Ecoles de musique (ABEM) et de l'Association suisse des Ecoles de musique (ASEM). C'est la LEMu (Loi sur les écoles de musique du 8 juin 2011) qui réglemente son activité et son fonctionnement financier. A noter que l'EMJB est la seule école de musique francophone du canton de Berne.