L'EMJB, à l'instar des 28 autres écoles de musique reconnues du canton de Berne, est organisée selon le décret du 24 novembre1983 sur les écoles de musique et les conservatoires (ainsi que selon les modifications du 10 mars 1998).

L'Ecole de Musique du Jura bernois est constituée en association au sens des articles 60ss CCS.

Les organes de cette association sont:

- l'assemblée générale

- le comité

- la direction

- les vérificateurs de comptes

Sont représentés à l'assemblée générale les membres individuels ou collectifs de l'association, les communes de domicile des élèves ainsi que les communes participantes. L'AG est réunie deux fois par année pour, entre autre, superviser la marche financière de l'institution.

Le comité de l'EMJB est élu par l'assemblée générale et constitue la commission de surveillance de l'école. Il se compose des membres suivants:

M. Philippe Châtelain, Président, Villeret

M. Daniel Keller, vice-président, Monible

M. Christian Marthe, représentant de la Municipalité de Sonvilier

Mme Nicole Voumard, représentante de la Municipalité de Tavannes

Mme Nicole Leblois, représentante de la Municipalité de Saint-Imier

M. Carlo Liechti, représentant de la Municipalité de Sonceboz

Mme Sonia Maire, représentante de la Municipalité de Tramelan

Mme Irma Hirschi, représentante de la Municipalité de Moutier

Mme Jeannette Fiechter, représentante des membres, Villeret

M. Jean-Robert Widmer, représentant des membres, Villeret

M. Olivier Rouget, représentant des professeurs, La Chaux-de-Fonds

M. Philippe Krüttli, directeur, Saint-Imier

Mme Sandra Oppliger, secrétaire, Saint-Imier

L'Ecole de Musique du Jura bernois est membre de l'Association bernoise des écoles de musique (ABEM), de l'Association suisse des écoles de musique (ASEM), ainsi que de l'Association des conservatoires et écoles de musique de l'arc jurassien (CEMAJ).